办理福建省烟草专卖零售许可证，需遵循《中华人民共和国烟草专卖法》及其实施条例的相关规定，按照以下流程进行：

申请人资格审查：申请人需具备良好的商业信誉和经营能力，无违法违规行为记录。

提交申请材料：申请人需向所在地烟草专卖行政主管部门提交以下材料：

烟草专卖零售许可证申请表；
法定代表人身份证明文件；
营业执照副本；
经营场所证明材料（包括产权证明或租赁合同等）；
经营场所地理位置图；
申请人及从业人员健康证明；
其他依法需要提交的材料。

现场核查：烟草专卖行政主管部门将对申请人的经营场所进行现场核查，评估是否符合烟草零售经营的条件。

审批决定：经过审核和现场核查后，烟草专卖行政主管部门将作出是否批准发放烟草专卖零售许可证的决定。

领取许可证：经批准的申请人将领取烟草专卖零售许可证，方可开展烟草制品零售业务。

请注意，具体的申请程序和所需材料可能会根据当地烟草专卖行政主管部门的要求有所不同，建议在申请前向当地烟草专卖行政主管部门咨询详细的办理指南和要求。同时，申请人应确保所有提交的材料真实、准确、完整，以免影响审批进程。